Na maior parte do tempo, as populações de daphnias são constituídas apenas por fêmeas que se reproduzem por partenogénese cíclica, dando origem a clones. 

Nascimento de 8 clones de daphnias fêmeas - partenogénese (reprodução assexuada) Ver filme

Quando as condições ambientais não são favoráveis, a daphnia reproduz-se sexuadamente.